Über die strategische Ausrichtung der Forschungsstiftung sowie die Mittelvergabe entscheidet ein vom Universitätsspital unabhängiger Stiftungsrat. Er kann sich auf die Empfehlungen eines wissenschaftlichen Beirates abstützen, der über das erforderliche Fachwissen verfügt. Bei Bedarf kann der Stiftungsrat weitere Expertinnen und Experten beiziehen.
Der Stiftungsrat ist oberstes Organ der Stiftung, arbeitet ehrenamtlich, und setzt sich zusammen aus Persönlichkeiten aus Wirtschaft, Forschung und Politik, welche der Region Basel, dem Universitätsspital und der Universität Basel verbunden sind. Er ist vom Verwaltungsrat des Universitätsspital Basel jeweils für eine Amtsdauer von vier Jahren gewählt.
Prof. Dr. Dr. h.c. Marcel Tanner (2015 - 2023, Präsident 2018 -2023)
Dr. Pascale Vonmont (2019 - 2023)
Dr. Bruno Dallo (2019-2023)
Prof. Dr. Gerhard Christofori (2018 - 2022)
Dr. Dr. h.c. Georg Krayer (2015 - 2018)
Prof. Dr. Edwin Constable (2015 - 2018)
Pierre Jaccoud (Präsident 2015 -2018)
Elisabeth Schneider-Schneiter (2015 - 2017)